El Instituto de Investigaciones en Ciencias de la Salud de la Universidad Nacional de Asunción (IICS-UNA) albergó un curso presencial dirigido a estudiantes de grado, maestría, doctorado y profesionales de la salud. Bajo el título «Herramientas de genómica, de biología celular y estructural y del diseño racional de fármacos para el diagnóstico y la prevención de las infecciones por E.coli diarreogénico de transmisión alimentaria», el evento fue organizado por la RED Latinoamericana STEC/SUH y contó con la coordinación de Isabel Chinen, Rosa Guillén y Cristina Ibarra. El programa, que se extendió del 3 al 5 de agosto, se estructuró sobre tres ejes temáticos principales: el estudio genómico y análisis bioinformático, el desarrollo de estrategias de prevención centradas en la biología estructural de la toxina Shiga, y el análisis de modelos celulares y clínicos del Síndrome Urémico Hemolítico (SUH).
Estudio de los genes de la E. coli
En cuanto al primer eje, enfocado en el estudio genómico aplicado a la caracterización del E. coli diarreigénico, las jornadas combinaron teoría y prácticas de laboratorio. Se abordaron la clasificación de categorías bacterianas y el uso de la tecnología de secuenciación Oxford Nanopore, incluyendo la configuración de equipos (MinKnow) y la preparación de bibliotecas en celdas de flujo (MK1B).
Posteriormente, las sesiones de bioinformática permitieron a los asistentes trabajar en el análisis de genomas completos mediante plataformas en línea, enfocándose en el ensamble de secuencias, métricas de calidad, serotipificación, identificación de genes de virulencia y resistencia, plásmidos, MLST, anotación y el análisis de brotes.
Diseño de fármacos
El segundo componente del curso desarrolló estrategias preventivas fundamentadas en la biología estructural de la toxina Shiga, con el objetivo de prevenir el Síndrome Urémico Hemolítico (SUH). Las y los participantes se adentraron en el análisis estructural de proteínas bacterianas, el diseño racional de fármacos y el estudio de moléculas pequeñas con actividad antitoxina. A través de prácticas guiadas, aprendieron a utilizar bases de datos de estructuras proteicas experimentales (Protein Data Bank) y predichas (AlphaFold y SWISS-MODEL).
Asimismo, emplearon softwares libres (como ZINC, ChimeraX, PockDrug y AutoDock Vina) para la búsqueda de blancos proteicos, el reconocimiento de «bolsillos drogables» en la toxina Shiga de tipo 2 (Stx2), simulaciones de «docking» molecular y la evaluación de energías de unión para el reposicionamiento de fármacos.
Respuesta a infecciones
En su último eje temático, el programa abordó integralmente la respuesta fisiopatológica ante las infecciones por E. coli productor de toxina Shiga. Se estudió la situación actual del SUH en América Latina, detallando los mecanismos de lesión intestinal y renal aguda, así como su progresión a la cronicidad. Estas bases clínicas se consolidaron con la resolución de un caso clínico de SUH y la observación microscópica de preparados histológicos renales e intestinales (con tinciones de PAS o Tricrómico de Mason), obtenidos a partir de cultivos primarios y modelos de experimentación animal inoculados con Stx2.
El curso, que se enmarcó dentro del Programa Iberoamericano CYTED, concluyó con una sesión final de evaluación de resultados y la posterior entrega de certificados. Además de las coordinadoras, la instrucción teórica y práctica estuvo a cargo de un cuerpo docente integrado por Elizabeth Miliwebsky, Claudia Carbonari, Cynthia Maiztegui, Chintya Díaz, Fátima Rodríguez, Magali Martínez, Roxana Toriano, Elsa Zotta, Claudia Silberstein, Federico Ochoa y Daiana Gioia.